La gouvernance est une manière différente de réfléchir, de prendre des décisions et d'évaluer les politiques, avec une multiplication des lieux et des acteurs impliqués. Elle renvoie à la mise en place de nouveaux modes de pilotage fondés sur le partenariat, l’interaction entre l’Etat, les collectivités territoriales et les acteurs de la société. C'est l'un des neufs défis de la stratégie nationale de développement durable et l'un des grands chantiers du Grenelle de l'environnement. Concrètement cela passe par l’information, l'éducation, la formation, la concertation, le partenariat, la transparence des décisions. La gouvernance se décline à toutes les échelles. Il faut donc veiller à la cohérence et à la bonne articulation de ses différentes échelles.

En Alsace, l'implication du monde associatif en réponse aux préoccupations environnementales est forte et ancienne. En atteste notamment la structuration en réseau des associations (Alsace nature, Office des données naturalistes - ODONAT -, Association régionale pour l’initiation à l'environnement et à la nature en Alsace - ARIENA -, etc.). La coopération entre l'Etat, la Région et les deux Départements est particulièrement développée. Le partage de l'information et la co-construction des politiques environnementales s'incarnent dans de multiples dispositifs et outils. La coopération transfrontalière est par ailleurs très en pointe sur les aspects environnementaux.